Logo szkoły Podstawowej w Myśligoszczy przedstawia dziecko niepełnosprawne ruchowo, na wózku inwalidzkim, trzymające za rękę dziecko zdrowe, na tle budynku szkoły. Logo ukazuje prawdziwy wizerunek szkoły w Myśligoszczy, która jest szkołą integracyjną, gromadzącą uczniów w pełni sprawnych, a także niepełnosprawnych – zarówno fizycznie, jak i umysłowo. Żywe, wyraźne kolory, zieleń wokół szkoły – z jednej strony przedstawiają rzeczywiste otoczenie szkoły, z drugiej zaś wskazują na fakt, że wszystkie dzieci uczące się w tej szkole znajdują życzliwą, rodzinną, pełną akceptacji atmosferę. Dlatego też słońce, które swoimi promieniami otacza szkołę i dzieci, ma uśmiechniętą twarz, jak wyobrażają je sobie najmłodsi.
Autorką projektu logo oraz jego wykonawczynią jest pani Małgorzata Gozdera – katechetka, pracująca w naszej szkole.